免疫缺陷新冠患者病毒追踪：感染逾百天，病毒在体内发生演化

在超长期持续感染新冠病毒（SARS-CoV-2）的过程中，病毒在患者体内会发生什么变化？

当地时间2月5日，国际顶级学术期刊《自然》（Nature）以“加快评审文章”(Accelerated Article Preview)形式在线发表了由英国剑桥大学、伦敦大学学院、牛津大学等团队的一项新冠病毒感染病例的研究，他们发现：一名免疫抑制患者在接受恢复期血浆治疗的同时出现了新冠病毒的不同变异株，接受血浆治疗后，占主导的SARS-CoV-2变异株含有英国发现的变异株B.1.1.7上的一个缺失突变。研究记录了在免疫缺陷宿主的持续感染过程中，SARS-CoV-2在抗体治疗中的重复演化反应。结果提示了一种可能性，即当免疫抑制患者出现长期病毒复制时，他们体内的SARS-CoV-2可能会发生演化。

该研究的通讯作者为英国剑桥大学病毒学及临床微生物学教授、剑桥治疗免疫学和传染病学研究所核心研究人员Ravindra Gupta。

Gupta及其同事描述了一个病例研究，研究对象是一名感染了SARS-CoV-2的七十多岁的免疫抑制男性患者，曾接受过淋巴瘤化疗。这名患者于2020年夏季入院，在101天里接受过抗生素、类固醇、几个疗程的瑞德西韦和恢复期血浆治疗，但都不见效。

研究团队在23个不同的治疗时间点采集了病毒样本。造成感染的SARS-CoV-2变异株属于谱系20B（在刺突蛋白上携带了会造成D614G替换的突变）。

在患者前57天服用两个疗程的瑞德西韦后，研究观察到总体病毒群体结构变化不大。然而，在恢复期血浆治疗后，研究观察到大量动态的病毒种群变化。

他们发现一个变异株比例开始增加，这个变异株的刺突蛋白（S蛋白，病毒感染宿主的“钥匙”）上出现了两个突变：一个是位点69/70的缺失突变（出现在英国变异株B.1.1.7中），还有一个会造成D796H替换的突变。这个种群在第三轮瑞德西韦（第93天）和恢复期血浆（第95天）治疗后又重新出现。

体外实验显示，带有69/70和D796H的S蛋白逃逸双突变体对恢复期血浆的敏感性略有降低，但感染性与野生型相似。研究提到，D796H似乎是降低易感性的主要原因，69/70单突变体的感染性则是野生型的2倍，这可能也弥补了D796H的感染性降低。

研究认为，这些数据显示，在出现病毒变异的恢复期血浆治疗期间，SARS-CoV-2受到了强烈的选择。有证据表明，病毒对中和抗体的敏感性降低，这些病毒对含有多克隆抗体的恢复期血浆的敏感性降低了一半。

但他们总结表示，这个变异株的出现不是治疗失败的主要原因。

研究同时强调，这只是单个病例研究，因此只能对结果进行有限的外推。但是，研究结果或能提醒人们警惕使用恢复期血浆治疗免疫抑制患者的SARS-CoV-2感染。

值得注意的是，变异毒株B.1.1.7以及古普塔等人的研究，也给世界提出了一个醒：需要关注免疫系统脆弱人群在新冠大流中的潜在作用。如果他们为病毒提供了进化谱系的机会，而新产生的谱系传播速度更快，更具致病性或没有疫苗，那么这些慢性感染不仅对患者构成危险，而且还可能改变新冠大流行的进程。